海水淡化工程多采用投加液氯、NaC10和CuS04等化学试剂来杀菌灭藻。考虑到交通等多方面的因素，投加化学试剂杀菌灭藻有一定难度，在本工程设备研制过程中专门采用海水次氯酸钠发生器。海水取水泵后分出一小股带压海水，进入次氯酸钠发生器，在直流电场作用下产生NaC10，靠位差直接注入海滩沉井，以杀系灭海水中的细菌、藻类和微生物。
由于海水硬度高海水直接电解产生NaC10必须克服发生电极结垢问题。在研制过程中，借鉴了电滲析频繁倒极(EDR)技术，即每隔5～10min倒换一次电极极性，有效地解决了次氯酸钠发生器结垢沉淀问题。
